Banyak orang mengunjungi Yogyakarta untuk alasan religius, mencari ketenangan batin di tempat-tempat ziarah. Selain candi-candi sebagai tempat ziarah penganut Hindu dan Buddha, Yogyakarta juga memiliki makam pendiri Kerajaan Mataram Islam di Kotagede, dan tempat ziarah penganut Katolik di Gereja Ganjuran.
GEREJA GANJURAN
GUA MARIA TRITIS
MASJID KOTAGEDE
DUSUN MLANGI
SENDANG SONO
SENDANG SRININGSIH